基本的な考え方は、環境を汚染することのない生産工程を用いたり、異業種産業（企業）の連携によって廃棄物の再利用をしたりすることで、社会全体で廃棄物排出ゼロのシステムを構築する、またはそれを構築するように目指すことをいいます。
ラボタではこのゼロエミッションの考えに基づき、「海を汚さない循環型浄化システム」を導入し汚れた海水をそのまま海に捨てずに、ろ過・浄化をしオゾン殺菌後、海水を再利用しています。
また、糞や餌の残りは発酵処理機で肥料にして自然へ還元しています。